https://frosthead.com

Tardigrade povećavaju kontroverzu i prikazuju znanost u akciji

Nema sumnje da su mikroskopski vodeni beskralješnjaci poznati kao tardigradi, mahovina ili vodeni medvjedi čudni. Čudno obožavatelji mogu preživjeti vakuum prostora, podnijeti isušivanje sušom i pojaviti se živi nakon zamrzavanja, među ostalim podvizima. Nedavna studija sugerira da su tardigrade također trgovci genima - da njihovi genomi sadrže više DNK iz nepovezanih biljaka, bakterija i drugih mikroba nego bilo koja druga životinja na Zemlji, nedavno je izvijestila Rachel Nuwer za Smithsonian.com . Ta sposobnost može čak objasniti zašto su tardigradi toliko otporni, sugeriraju istraživači.

No otprilike tjedan dana nakon najave tog iznenađujućeg otkrića, druga je grupa osporila te nalaze, izvještava Ed Yong za The Atlantic . Brzi napredak između dva tima pokazuje koliko reakcija u znanosti i potencijalno samoispravljanje može biti u digitalnom dobu.

Prvo istraživanje, sa tima sa Sveučilišta u Sjevernoj Karolini, izvijestilo je da jedna tardigradna vrsta ima ogromnih 6.600 gena koji su izvorno pripadali organizmima iz drugih kraljevstava - uglavnom bakterijama, ali i gljivicama, biljkama, virusima i arhaama, a stečena putem proces naziva horizontalni prijenos gena. Ti nalazi značili su da se genom Hypsibius dujardini sastoji od oko 17, 5 posto stranog DNK-a, izvijestio je tim u Proceedings of the National Academy of Sciences . Budući da su neki strani geni uključeni u stresne reakcije drugih organizama, istraživači sumnjaju da su im mogli dati tardigrade s nekim svojim vlastitim jedinstvenim sposobnostima za vremenske ekstremne uvjete.

Međutim, druga skupina sa Sveučilišta u Edinburghu također je sekvencirala iste vrste tardigrada i dobila vrlo različite rezultate. Ti su istraživači otkrili da kreator ima između 36 i 500 vodoravno prenesenih gena - što je znatno manji postotak. Kad je UNC-ov rad izašao, rezultati u Edinburghu još uvijek nisu objavljeni, ali istraživači su pokušali objaviti svoja otkrića na web serveru za tisak bioRxiv.org - web stranici na kojoj se rukopisi mogu objaviti prije nego što se pošalju u časopis i stručna recenzija tipična za znanstveno istraživanje.

Edinburška skupina sumnja da je UNC skupina možda "sekvencirala DNK od bakterija koje su živjele duž tardigrada i, unatoč njihovim najboljim naporima, pogrešno su zamenile gene tih mikroba za prave tardigradne gene", piše Yong. Ali kako je prva skupina mogla pogriješiti, ako doista jesu? Yong objašnjava da tehnologija sekvenciranja genoma uključuje sjeckanje DNK na sitne komade i zatim ponovno sastavljanje djelića u koherentnu sliku. Neka kontaminacija lako može kliznuti, pa se znanstvenici trude da utvrde koji komadići pripadaju organizmu koji proučavaju, a ne mikrobovima u blizini.

Edinburška skupina shvatila je da su neki fragmenti DNK rijetki, u usporedbi s drugim fragmentima. "Nema šanse, biološki oni mogu biti dio istog genoma", kaže vođa tima Mark Blaxter za Yong. Skupina je zaključila da u gardu tardigrada ima 500 gena koji su mogli poticati iz drugih izvora, ali za 36 njih postoje samo snažni dokazi. To daje tardigradu mnogo tipičniji udio stranog DNK za životinju.

U komentaru na najnoviji rad, Thomas Boothby i Bob Goldstein iz UNC-a ističu da su bili svjesni ovog potencijalnog problema i naporno su radili kako ne bi utjecao na njihove rezultate - ali da uvijek postoji mogućnost pogreške. Dodaju kako će prije dodatnog komentara napraviti dodatnu analizu. Istraživači su također istakli da cijene odluku svojih rivala da tako brzo objave svoje oprečne rezultate na bioRxiv.org .

Osjećaji su bili obostrani. Sujai Kumar iz edinburškog tima rekao je Yongu da ako UNC grupa ne objavi svoje podatke odmah, to bi za njihovu grupu bilo izazovnije. "Ono što je očigledno je nevjerojatna nova sposobnost znanosti da se brzo ispravlja", Blaxter kaže Yong-u. Ono što je u ovom slučaju trajalo samo devet dana, prošlo bi već nekoliko mjeseci.

Za sada je porota još uvijek svjesna koliko gard tardigrada dolazi iz stranih izvora. Ali čak i ako ta sićušna stvorenja nisu genske krađe, možda će još neko vrijeme biti nasumični krađe.

Napomena urednika: Ovaj je članak uredila Rachel Nuwer, koja je izvorno izvijestila o istraživanju tardigrada za Smithsonian.com.

Tardigrade povećavaju kontroverzu i prikazuju znanost u akciji