Uzgoj lososa primio je svoj dio kritike zbog štetnosti za okoliš. Mnogo lososa se uzgaja u mrežnim olovkama koje omogućuju širenje ribljih otpadaka, kemikalija i nusproizvoda iz divljine u divljinu. Postoji i prijetnja patogenima koji bi mogli napredovati u prepunim olovkama i pobjeći da naštete prirodnim ribljim populacijama. Nekada se smatralo da jedna od bolesti, zarazna anemija lososa, predstavlja isključivi problem isključivo uzgojenog atlantskog lososa. Nova studija skupine istraživača sa sveučilišta Simon Fraser u Britanskoj Kolumbiji otkrila je da ovaj virus nalik gripu zaražava prirodnu populaciju lososa.
Zarazna anemija lososa prvi put je primijećena 1984. godine i javlja se najčešće u prenapučenim, prljavim olovkama lososa. Kao što ime sugerira, virus uzrokuje anemiju, stanje u kojem tijelo nema dovoljno zdravih crvenih krvnih zrnaca da bi isporučivalo kisik tkivima. Zaražene ribe mogu pokazati simptome - poput blijedog škrge i gubitka apetita - ili izvana mogu izgledati sasvim u redu. Iako bolest ne predstavlja nikakav rizik za ljude, ona može izbrisati više od 70 posto populacije u uzgoju lososa.
Ovo je prvi put da je bolest pronađena u divljim ribama uz obalu Sjeverne Amerike. Nakon što su opazili pad populacije lososa uz obalu Britanske Kolumbije, istraživači su prikupili 48 uzoraka za proučavanje i otkrivanje dviju maloljetničkih riba zaraženih ovom bolešću. Iako zasad nema dokaza koji bi definitivno povezali uzgoj ribe s prisutnošću anemije lososa u divljim populacijama, moglo bi doći do razornih posljedica, ne samo za ribarstvo, već i za divljinu koja o hrani ovisi o lososu. "To je hitno stanje bolesti", izjavio je Associated Press James Winton, direktor sekcije za zdravlje riba u Sjedinjenim Američkim Državama. "Zabrinuti smo. Ako bi ga uveli, mogao bi se moći prilagoditi pacifičkom lososu. "